Инструменты пользователя

Инструменты сайта


howto:root:pandaroot

Установка PandaRoot на VBox

Предварительная подготовка

Убедиться, что у вас 64-битная машина.

В BIOS включить опции «Intel VT» или «AMD-V».

Установка ViritualBox

Скачиваем последнюю версию VirtualBox и VirtualBox Extension Pack с сайта. Устанавливаем командой:

  # dpkg -i virtualbox-5.0_*_amd64.deb 
  # VBoxManage extpack install Oracle_VM_VirtualBox_Extension_Pack-*.vbox-extpack 

Создаем (или импортируем) виртуальную машину с Ubuntu. Если устанавливаем с нуля, то диск лучше делать динамическим и разбить его на два раздела: 16 ГБ под систему и 20 ГБ под home. Раздел подкачки лучше не создавать, а использовать файл подкачки на системном разделе (установить пакет dphys-swapfile).

В гостевой Ubuntu устанавливаем «Дополнения гостевой ОС» (VirtualBox guest additions).

Сносим лишние пакеты, устанавливаем нужные:

  apt-get install aptitude pv vim checkinstall screen openssh-server 
  sudo apt-get remove --purge evince thunderbird empathy gwibber gnome-games-data aisleriot indicator-messages software-center 
  
  sudo aptitude install gnome-session-fallback
  sudo aptitude install etckeeper
  

Установка PandaRoot

Инструкция по установке Если следовать инструкции, получится директория с кашей из софта. Процесс сборки занимает около полутора часов на core i7 с 8ГБ оперативной памяти.

Для компиляции PandaRoot необходимо предварительно утановить FairRoot и FairSoft. Сборка FairSoft, FairRoot из исходных кодов – очень ресурсоемкий процесс, который к тому же порядка 10ГБ свободного пространства на диске. Поэтому рекомендуем собрать FairSoft и FairRoot на реальном компьютере с той же версией операционной системы, а затем перенести их на виртуальную машину.

Сборка пакета FairSoft и FairRoot

Чтобы установить собрать пакеты, которые легко будет перенести на виртуальную машину, нужно немного отклониться от инструкции.

0. Предварительные требования

sudo apt-get install cmake cmake-data \
  g++ gcc gfortran   build-essential make patch sed libx11-dev \
  libxft-dev   libxext-dev libxpm-dev libxmu-dev libglu1-mesa-dev \
  libgl1-mesa-dev ncurses-dev curl bzip2 gzip unzip tar \
  subversion git xutils-dev flex bison lsb-release \
  python-dev libc6-dev-i386 libxml2-dev wget libssl-dev \
  libboost-dev checkinstall

Дополнительно нужно установить libcurl-dev (в Убунту – libcurl4-gnutls-dev)

1. Установка FairSoft

FairSoft – это готовый скрипт, устанавливающий набор необходимых программ: ROOT5/6, Geant4, Pythia8 и т.п.

Клонируем только файлы неободимого релиза (тега – в терминологии git) в директорию fairsoft_mar15p2.

export TAG=mar15p2
git clone --branch $TAG --depth 1 https://github.com/FairRootGroup/FairSoft fairsoft_$TAG 
cd fairsoft_$TAG
sudo mkdir -p /opt/fair/fairsoft.$TAG
sudo chgrp -R users /opt/fair/fairsoft.$TAG
chmod g+ws /opt/fair/fairsoft.$TAG
time ./configure.sh
    << Отвечаем цифрами, а когда спросят path:, указываем /opt/fair/fairsoft.mar15p2 >>

2. Установка FairRoot и сборка пакета

Собираем мартовскую версию FairRoot:

export SIMPATH=/opt/fair/fairsoft.mar15p2/
ls $SIMPATH
export FRTAG=15.03a
git clone --branch v-$FRTAG --depth 1 https://github.com/FairRootGroup/FairRoot fairroot_$FRTAG
cd fairroot_${FRTAG}/
mkdir build
cd build
cmake -DCMAKE_INSTALL_PREFIX=/opt/fair/fairroot${FRTAG} ../
make -j 8 #число процессоров в системе
   << При сборке следим, чтобы системная память не переполнялась. Если система "ушла в swap", останавливаем make нажатием Ctrl-C и перезапускаем с меньшим числом процессов. >>
rm -r /opt/fair/fairroot${FRTAG}
sudo checkinstall
Отвечаем на вопросы checkinstall: 
   
0 -  Maintainer: [ ]
1 -  Summary: [ Fairroot custom built. ]
2 -  Name:    [ fairroot-15.03a ]
3 -  Version: [ 0 ]
4 -  Release: [ 1 ]
5 -  License: [ GPL ]
6 -  Group:   [ checkinstall ]
7 -  Architecture: [ amd64 ]
8 -  Source location: [ https://github.com/FairRootGroup/FairRoot ]
9 -  Alternate source location: [  ]
10 - Requires: [  ]
11 - Provides: [ fairroot15 ]
12 - Conflicts: [  ]
13 - Replaces: [  ]
. >>

Cборка pandaroot

Переносим fairsoft.tar.gz и fairroot…deb на виртуальную машину.

Распаковываем fairsoft:

  sudo tar -xfzf fairsoft.tar.gz -C /

Устанавливаем fairroot:

  sudo dpkg -i fairroot*.deb

Скачиваем и собираем pandaroot:

export FAIRROOTPATH=/opt/fair/fairroot-15.03a/
export SIMPATH=/opt/fair/fairsoft.mar15p2/
svn co https://subversion.gsi.de/fairroot/pandaroot/release/mar15 pandaroot_mar15
cd pandaroot_mar15
mkdir build
cd build
cmake ../
make -j 8 # число процессоров виртуальной машины 
  << если для сборки не хватает оперативной памяти (машина "уходит в swap"), останавливаем make и запускаем с меньшим числом процессов. >>
  

Установка rootpy

Устанавливаем зависимости

  sudo aptitude install python-pip python-setuptools python-numpy python-matplotlib python-termcolor
  

Устанавливаем в домашнюю директорию:

. thisroot.sh
pip install --user rootpy
howto/root/pandaroot.txt · Последние изменения: 2020/03/24 16:24 — ryzhikov